该片情节跌宕起伏，集集都含着精彩，最激烈的战斗。数码暴龙在数码世界网络中大肆破坏，为了令数码暴龙恢复和平，每个人都集着友情和团结之力，打败了敌人！该片为你揭开数码暴龙神秘面纱，齐齐进入这个欢乐世界吧！
数码世界事件发生三年后的某天，太一突然收到亚古兽来自数码世界的求救。原来凶残的神秘少年暴龙改造者出现了，他的黑暗力量叫数码暴龙们都无法进化。此时新的电波暴龙机出现，名叫大辅的少年化身为新被炼选的小孩进入数码世界。新的冒险看来要开始了！另外，阿和等人也相继收到数码宝贝们的求救讯号而前往数码世界。原来暴龙改造者姿意肆虐，用武力要令大家都成为他的仆人。看来，数码宝贝们的路并不易走，前面的路危机重重……
大家热爱现实世界的数码世界之心能否将地球危机平息？誓要梦想成真的力量能否匹敌最大魔头的力量？
这一年地球气候异常……
七个小朋友太一、阿和、阿空、光子郎、阿丈、美美、阿武正在露营，突然一场大风雪来临。大风雪过后，七人意外地发现身上有一个类似闹钟的仪器，然后众人突然全部消失了。他们来到了一个陌生的地方，而且每个人都有一个自称是数码兽的生物同伴。突然众人受到古加兽的攻击，并被逼到悬崖，尽管实力悬殊，但七只数码兽仍然为保护同伴奋力战斗。众人很感动，神秘仪器突然发出光芒，七只数码兽突然进化了。他们的实力加强了许多，齐心协力终于打倒了古加兽。正当大家庆祝胜利时，古加兽又站起来了，并将众人打下悬崖……
第2集 爆裂进化！暴龙兽
关键时刻，歌玛兽召唤出金鱼救了所有人，众人讨论了一下关于这里以及数码兽，但毫无结果。然后众人来到大海处，发现电话亭，但每个电话都不停地重复讲奇怪的时间，而且打不通。众人分配了食物，太一给了亚古兽一点。这时，贝壳兽出现了。除了亚古兽外，所有数码兽都因为没力气不能战斗。亚古兽最后不敌贝壳兽，太一为救他也被抓住。最后神秘仪器再次发光，亚古兽进化成暴龙兽并把贝壳兽打走了。
第3集 灰狼，加鲁鲁兽
太一不明白为什么亚古兽进化后又退化，大家都不知道。他们突然看见两只性格温顺的角龙兽打架。大家发现一个在湖心小岛上的无人电车，阿和也道出阿武是他弟弟，但父母离异。于是大家决定在那里过夜。太一在守夜时踩中连在小岛上的海龙兽的尾巴，致使它疯狂起来，阿武掉入水中，阿和为救他陷入险境。最终加布兽进化成加鲁鲁兽打败了海龙兽。
第4集 灼热，巴多拉兽
比丘兽总是话不停，引起空的不满。众人离开森林，来到一个磁粉沙漠，太一用望远镜发现了比高兽的村庄。然而水井里面突然喷出火来。水源所在的山的守护者火焰兽也发狂似的冲下来。比丘兽在疏散比高兽的时候落在了最后，遭到火焰兽的攻击从小山山掉下来。阿空立即冲过去抱住她。其他数码兽用火焰攻击火焰兽时他越变越大。火焰兽准备跳下去时比丘兽保护阿空的决心使她进化成巴多拉兽，最终打败火焰兽。从火焰兽身子里飞出几个黑色齿轮。
第5集 电光，比多兽
光子郎没有电池的手提电脑突然有电，大家非常奇怪。太一他们到了一间无人工厂，所有机器都将零件组装再分解，光子郎进入了一个充满了古怪文字的巨型电池型的动力房，将其中一划抹去，突然整间工厂停电，光子郎将那一划加上，电力就恢复了，光子郎想尝试分析那个程序，但因为甲虫兽突然过热而停住。另一方面，受黑色齿轮影响的安杜路兽杀太一他们，虽然亚古兽及加布兽都进化，但始终打不赢完全体的安杜路兽，光子郎再次尝试执行那个程序，甲虫兽进化成为比多兽，并将安杜路兽打败。大家从下水道出去时，光子郎的电脑又突然没电了。
第6集 巴鲁鲁忍无可忍的进化
离开了下水道之后，太一他们因为遇到一大群的鼻涕兽而各自逃亡，美美遇上发狂的熊仔兽，但经由鼻涕兽的帮助而逃过一劫。美美进入了玩具之城，但是发现太一他们非常的不正常，像没有了感情一样，而且跟随他们的数码怪兽也不知去向。在一间屋子里头找到了亚古兽牠们，但是却被锁着。熊仔兽攻击美美，鼻涕兽为了要保护美美而组合起来挡住可爱攻击，巴鲁兽非常感动，于是进化成为仙人掌兽，击败熊仔兽。原来熊仔兽因为受了黑色齿轮影响而将人类变成玩具的玩具，最后熊仔兽给了他们真正的爱心一击来作补偿。
第7集 咆哮，海狮兽
阿丈因为认为吃蛋只能加盐而被歌玛兽说死板。晚上，太一与阿和为是否上一座高山而争执，阿丈越帮越忙。阿丈为自己是七人中最大的却帮不了忙自责，于是深夜与歌玛兽上山。黎明时，亲眼目睹黑色齿轮进入温顺的独角马兽使它发狂。太一他们赶到但不够打。阿丈欲将独角马兽的黑色齿轮弄下来，但被其甩下去。歌玛兽及时进化成海狮兽救下阿丈并打碎黑色齿轮。众人上了山顶却发现这里是个孤岛。
第8集 黑暗使者恶魔兽
正义的狮子兽被恶魔兽灌入黑暗力量失去意念，和奥加兽去袭击众小朋友。但他们不敌六只成熟期。恶魔兽推下石头想攻击他们，也未成功。众人发现了一间大屋，由于亚古兽牠们太疲累，被逼在大屋过夜。夜里当亚古兽在厕所时，被狮子兽和奥加兽袭击，而且大屋原来是恶魔做出的幻觉，当太一面临危险时，神秘仪器发出光芒，驱散了狮子兽体内的黑暗力量使他回复正常，然而当太一漂走后，狮子兽再次受到恶魔兽的控制。
第9集 冲撞，冷冻数码宝贝
太一及亚古兽漂流到一个冰岛，发狂的雪人兽袭击他们，亚古兽将雪人兽的黑色齿轮弄走。雪人兽告诉太一阿和跌了到另一个岛，而且为报答太一，为他建了一条冰路到大和那个岛。另一方面，阿和为寻找阿猛，在风雪里感冒了，加布兽用自己的皮为阿和取暖，因而自己也得了感冒。太一，亚古兽和雪人兽来到，雪人兽去找草药。太一及阿和因意见不合而吵架，滑了下山，幸得雪人兽经过。毛人兽袭击他们，太一他们使牠回复正常。 战斗时一座山被撞裂，露出黑色齿轮。加鲁鲁兽往那里喷射火焰使那小岛飘回档案岛。