第16集
小智等人到达卡那兹市。向芳缘地方第一场道馆挑战赛的曰子终于到了。从以前就对比赛绝招华丽度的神奇宝贝华丽大赛有兴趣的小遥，下定决心参加华丽大赛，放弃到道馆挑战比赛。这次成了小智一个人的挑战。为了对抗擅长使用高防御力的岩石系神奇宝贝的道馆训练家杜娟，小智与皮卡丘苦练对岩石系效果优越的绝招「钢铁尾巴」。然而，无法随心所欲使出该绝招的皮卡丘还是陷入了苦战。在杜娟的岩石神奇宝贝朝北鼻的强烈攻击下，皮卡丘到底能不能及时使出新绝招「钢铁尾巴」呢.!,
第17集
打赢了卡那兹道馆的比赛，小智一行人的心早就飞向下一个目的地武斗道馆。等待搭船到武斗岛的期间，一行人决定在卡那兹市分开来自由行动一阵子。小胜在街上认识了从衣服到食品、什么都生产的梦幻公司，得文制造股份有限公司的社长，兹伏奇。喜欢小孩的兹伏奇很欣赏小胜，带小胜到总公司参观，让小胜对一个又一个的新发明大开眼界。这时候，两人发现伪装成社员的可疑男子，展开了跟踪。同一时间，研究所内因为遭窃而一阵骚动。东西是这个男人偷走的吗？他的真实身份究竟是什么？
第18集
小智一行人想搭上每个月只有几班船的联络船到武斗岛。但是由于小遥的疏失，赶不上最近的班船。小遥为了负起责任，到处寻找开往武斗岛的船只，认识了退休的老船员哈奇。哈奇老人自愿送一行人到武斗岛。但是，等小遥带大家过来时，哈奇老人的态度却是180度大转变，冷淡的赶走一行人。百思不解的一行人，从君莎小姐那里听来令人担忧的消息。上次躲在得文公司的水舰队的人，听说就躲在这附近，打算与同伴会合。企图在海上与同伴会合的水舰队的男子，与拥有私人船只的哈奇老人的变化，二者似乎有某种关联。一行人抱着这样的想法，赶紧回到哈奇老人的地方。到底，哈奇老人与水舰队之间有什么样的关系？小智等人是否能够抓住水舰队呢？
第19集
为了出席下一场道馆的战斗，小智一行人乘着哈奇老人的小船朝着武斗岛移动。可是一行人却来到了无人岛，小遥和小胜跑到了海中玩水，却突然遭到一大群「凶暴神奇宝贝」巨牙鲨的包围，但幸好被皮卡丘救回了性命。夜晚，一行人在海边用餐，发现了几只巨牙鲨徘徊在岸边，一行人不以为然。隔早，莲叶童子被巨牙鲨咬了去，才发现巨牙鲨已经受了伤，小刚彻夜照顾牠。突然!!火箭队又出现了，将皮卡丘抓了去!!小智能将皮卡丘救出吗..他们能逃离这座岛吗.
第20集
为了尽快得到芳缘地方的第二个道馆徽章，小智等人来到道馆门口。然而，道馆训练家藤树却拒绝小智的挑战，跑出去冲浪。斗志高昂的小智气不过去，一直纠缠着藤树，最后终于如愿以偿。小智认定藤树是只晓得玩冲浪的吊儿啷当的人物，所以对这场比赛充满了自信。可是面对小智来势汹汹的攻击，藤树的神奇宝贝却运用冲浪中练出来的身手，很轻松的就化解小智的攻击。小智急得失去判断情况的能力，依然采用硬攻的方式，结果…:
第21集
在武斗道馆之战里面，小智被道馆训练家藤树打倒，感受到自己实力的不足，决定在武斗岛暂时修行一段时间。然而在那个时候，出现了企图夺走小智等人的神奇宝贝的火箭队！小智等人好不容易将火箭队赶跑，但是回过神来却注意到，小遥的刺尾虫跟火箭队的刺尾虫在混战中弄混了！刺尾虫是小遥第一次收服，细心照料的神奇宝贝，想到自己的刺尾虫被迫与卑鄙的火箭队待在一块儿，小遥就非常的不安。忍住盈眶的泪水，小遥拼命奔走寻找火箭队…。
第22集
为了武斗道馆而继续旅行了小智一行人，正在商讨着大吾的事情而来到了「岩石洞窟」，却意外掉入了火箭队所设下的陷阱。但是那个时候，周围的地面却陷了下去。一行人和火箭队一起掉进的洞穴的最深处。而在小胜的周围,皮卡丘和喵喵聚在一起。好像所有人都分散了。小智、小刚、小次郎在一起，而小遥和武藏在一起，寻找出口的活动开始了.「铁铠神奇宝贝」可可多拉就居住在这危险的洞穴里，争吵不停的３组联合起来，能逃出洞窟吗！？小智能和大吾相遇吗！？
第23集
小智一行人，在武斗岛边架设帐篷，继续着神奇宝贝的修行。那个时候，沙中突然出现的未知生物，袭击了小智一行人。打算捕获牠的小智，却因为牠的强大力量，而失败了。而且那个生物，还把帐篷给弄倒了。被吓到的小智，燃起的捕获谜的生物的欲望，决定揭发未知生物的原形。静静等待的夜晚的到来。于是当天晚上，未知生物还是出现了！！小智能顺利捕获未知生物吗！？