第1集 佛爷西逃
慈禧西逃，饮食成问题
小镇风情（地震前夕的平静），家道中落的老厨子逼小厨子学厨，振兴家业老厨子被抓，小厨子感到不妙
第2集 老厨被抓
老厨为弘扬家菜，大展身手，小李子打下手。老厨子边炒边幻想，小李子借机下毒。蜘蛛中毒掉进菜里，老厨子欲重新做菜，小李子不同意，两人争执间菜打翻冒出毒烟,小李子抢先一步栽赃，老厨子被投入大牢，老佛爷怒，光绪被软禁，小李子放信鸽
第3集 救爷爷
小李子招不到厨子，开出丰厚条件（免死金牌），小厨子揭皇榜进宫，小厨子凭神指做菜，做出来的菜却极难看。老佛爷再度传膳，小李子只得硬着头皮上菜。老佛爷饿极，连吃三碗。小李子喜，小厨子暂时留下。
神厨小福贵第4集 御膳厨房的规矩
小厨子做菜，无意间坏了厨房里的规矩 小李子对小厨子进行特训 勉强通过 小李子建议给慈禧弄点荤腥
第5集 肉在何方？
小厨子和小李子到处找肉，只找到三个鸡蛋 一个鸡蛋被老鼠偷走，两人老鼠时，一个鸡蛋被打烂，另一个孵出小鸡来跑掉。两人一气之下，捉老鼠泄愤 献上老鼠肉做的菜，老佛爷刚吃一口，大叫：“小李子——！”
第6集 太后有恙
老佛爷吃出病来，小李子以为是老鼠汤的问题，怀疑有毒，将小福贵关起来，待查明原因后发落。 小福贵急，欲探究老佛爷病情及根源，设计逃脱。 老佛爷病情渐重，小李子欲治小福贵的罪，却发现他已逃走，急。 小福贵找到老佛爷吃剩的东西，查明无毒，并得知老佛爷病的原因。小李子来，抓住畏罪潜逃的小福贵，告之本来可获封随行御厨，拿到腰牌，但现在被判斩立决。
第7集 刀下留人
找来一山村老医生，查明老佛爷的病是因暴饮暴食而致，开出药膳处方。 小李子为撇清干系正欲杀小福贵，却传来消息要厨师做药膳，连忙刀下留人。小福贵寻找药膳材料，却无法凑齐，想起爷爷的偏方，利用现有材料做出药膳。老佛爷大病初愈，离开小镇。小福贵死罪可免，活罪难逃，跟太后西行，以戴罪立功。在小李子的提示下，小福贵决定用鸽子给老佛爷进补。
第8集 信鸽入肴
小福贵找鸽子。 小李子等信鸽。 老佛爷生活渐好，光绪却因饿产生幻觉，老医生诊治要吃东西，向老佛爷讨要，老佛爷大怒，却诡辩皇上要辟谷。小福贵抓到鸽子，喜。然而下锅时，小李子才发现：那就是自己久等的信鸽。而小福贵却不知深浅地将写着“毒杀皇上”的信送到小李子面前。 小李子惊，怀疑小福贵知道密信内容，决定除掉他。
第9集 好心犯忌
小福贵做鸽子肉，欲为太后进补。 小李子拐弯抹角前来试探，看小福贵是否认识信上的那几个字，最后得知小福贵根本不认得，放心。膳成，小福贵本欲送给老佛爷，却传来皇上饿的不行的消息，善良的福贵于是先给了光绪，小李子有心借机惩罚小福贵，并不点破。 老佛爷怒，小福贵立功不成又挨扳子，沮丧，正在此时，人群来。
神厨小福贵第10 集 小厨救驾
老佛爷以为是迎接知县，却不料是土匪，队伍大乱。 老佛爷危险，大叫小李子，怕死的小李子却只顾保命。 光绪念及母子情欲救老佛爷，但因长期吃不饱而力量有限，不得，老佛爷有所触动。危难之时小福贵舍身相救，老佛爷安全，知县来，危机解除。 老佛爷对小福贵满意，对其封赏，小福贵却乘机提出要求：希望获封随行御厨。老佛爷决意考考他，点三道菜，满意即可过关，掷发簪定主题，第一题是鱼。
第11集 第一锅鱼
小福贵做水煮鱼，因老佛爷对光绪态度缓和，故也为光绪准备一份。 小李子下毒，见一大一小两个碗，便对分给光绪的小碗下毒，几经波折，下成。 小福贵准备送菜，却传来老佛爷旨意大碗给光绪。小李子急，慌忙又给大碗下毒，忙乱中却发现所有的鱼都中毒，没有给老佛爷的菜了，小李子只得全部倒掉。 小福贵发现鱼不见，不知其原因，只得重新来过。
第12集 石锅鱼
小福贵重新做鱼，提防着有人破坏。 小李子也怕再生变，谨慎地等最后确定光绪饭碗再下毒。 菜成，却被饥饿的光绪整锅端走。小福贵和小李子费尽心思，寻找锅子，最后用石头代替。小福贵做出石锅鱼，小李子再欲下毒，却传来老佛爷旨意要与光绪同食，小李子窃喜幸亏没下毒。 太后对石锅鱼满意，再掷发簪，定主题：饭。
第13集 还锅记
小福贵做八宝饭，光绪怀着歉意来还锅，小福贵正愁没有帮手，把光绪当做偷锅贼扣住做苦力打下手。 小李子欲在饭里下毒，不想被光绪打乱，无从下手。三人在厨房一通乱搞。小李子指派小福贵，小福贵指派光绪，光绪又绕回来指派小李子。 锅翻饭倒，小福贵气，将光绪赶走。
第14集 竹筒饭
小福贵重新做饭，为求新意做竹筒饭。 小李子来，认为下毒机会到，与小福贵一起去砍竹子。小李子竹筒的内壁上下毒，利用蒸气让毒不知不觉溶到饭里。 小福贵通过金食指发现饭中有毒，大惊。
第15集 请小福贵放心
小福贵急将发现有毒的事向小李子报告。 小李子想糊弄过去，小福贵却坚持一定要抓到下毒的人。小李子无奈，用木偶装扮成下毒之人，在小福贵面前演了一场自编自导的戏，小福贵误以为下毒之人已被除掉，打消疑虑。 老佛爷要到厨房瞧瞧的消息传来，饭已被倒掉，米又只剩一点，二人急。
第16集 老佛爷来厨房
厨房里冷锅冷灶，小福贵和小李子手忙脚乱用仅剩的一点米做绝味锅巴。老佛爷到厨房视察，对一切都好奇，打乱了小福贵的做菜计划（小福贵要炒，老佛爷说炒不好，要蒸）。锅巴献上，好吃但不符合饭局的要求，小福贵急，太后最后决定，如果第三道菜做得满意照样封他为随行御厨，但如果做不好，他将被趋赶出去。老佛爷出第三题，发簪掷到树干上。